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開學(xué)季技術(shù)大講堂——(一)抗體相關(guān)基本知識(shí)
發(fā)表者:北京博奧森生物      發(fā)表時(shí)間:2019-9-12


又是一年開學(xué)季,有的小伙伴剛進(jìn)入實(shí)驗(yàn)室,要投入忙碌而緊張的科研工作中了吧?

WB... 免疫組化... 免疫熒光...流式細(xì)胞...各種技術(shù)也是在勤學(xué)苦練當(dāng)中吧?

想學(xué)技術(shù)何必東奔西走,Bioss科學(xué)家早已經(jīng)把多年秘籍備好,準(zhǔn)備傾囊相贈(zèng)!

我們近期會(huì)連續(xù)介紹多種抗體應(yīng)用技術(shù)的標(biāo)準(zhǔn)操作流程和常見問題解決方案,你想要的全都有,持續(xù)關(guān)注本公眾號(hào),獲取更多資訊,讓你的實(shí)驗(yàn)做得輕松愉快又標(biāo)準(zhǔn)!


開學(xué)季技術(shù)大講堂——(一)抗體相關(guān)基本知識(shí)
抗體(antibody)是生物體在抗原物質(zhì)刺激下,由B細(xì)胞分化成的漿細(xì)胞所產(chǎn)生的、可與相應(yīng)抗原發(fā)生特異性結(jié)合反應(yīng)的免疫球蛋白(Ig)。按抗體的來源,可將其分為天然抗體和人工制備的抗體,是通過對(duì)特定生物體免疫接種特定抗原物質(zhì)后而獲得。人工免疫動(dòng)物制備的抗體應(yīng)用甚為廣泛,既可以用于科學(xué)研究,也可以用于疾病的預(yù)防、診斷和治療。


一、抗體的基本結(jié)構(gòu)
經(jīng)x線晶體衍射結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn),抗體Ig由四條多肽鏈組成,各肽鏈之間由數(shù)量不等的鏈間二硫鍵連接。Ig可形成“Y”字型結(jié)構(gòu),稱為Ig單體,是構(gòu)成抗體的基本單位。
(一)重鏈和輕鏈

天然Ig分子含有四條異源性多肽鏈,其中,分子量較大的兩條鏈稱為重鏈(heavy chain, H),而分子量較小的兩條鏈稱為輕鏈(Light chain, L)。同一Ig分子中的兩條H鏈和兩條L鏈的氨基酸組成完全相同。
1. 重鏈分子量為50000~75000,由450~550個(gè)氨基酸殘基組成。重鏈恒定區(qū)的氨基酸組成和排列順序不同,其抗原性也不同。據(jù)此,可將抗體Ig分為5類(class),即IgM、IgD、IgG、IgA和IgE, 其相應(yīng)的重鏈分別為μ鏈、δ鏈、γ鏈、α鏈和ε鏈,商品化的抗體絕大部分都是IgG。不同類的Ig具有不同的特征,如鏈內(nèi)和鏈間二硫鍵的數(shù)量和位置、結(jié)構(gòu)域的數(shù)量及鉸鏈區(qū)的長(zhǎng)度等均不完全相同。即使是同一類的Ig,其鉸鏈區(qū)氨基酸組成和重鏈二硫鍵的數(shù)量、位置也不同,據(jù)此又可將同類Ig分為不同的亞類(subclass)。
IgG的亞類
利用不同種屬動(dòng)物制備的IgG存在不同的亞類,常見的不同種屬IgG亞類如下:
? 兔: IgG(無亞類)
? 小鼠: IgG1, IgG2a, IgG2b, IgG2c, IgG3
? 大鼠: IgG1, IgG2a, IgG2b, IgG2c, IgM
? 山羊: IgG1, IgG2
在進(jìn)行某些抗體相關(guān)實(shí)驗(yàn)(如IF和FCM)的時(shí)候,我們常常需要仔細(xì)看一下所訂購(gòu)商品化抗體的IgG亞類,以方便我們選擇同型對(duì)照(isotype control) IgG (即與目的蛋白抗體相同來源種屬的相同類型正常IgG)作為抗體的陰性對(duì)照進(jìn)行平行實(shí)驗(yàn),以排除可能的非特異性染色結(jié)果。
2. 輕鏈分子量約為25000,由214個(gè)氨基酸殘基構(gòu)成。輕鏈可分為兩種,分別為kappa(κ)鏈和lambda(λ)鏈。據(jù)此,可將lg分為兩型(type),即κ型和λ型,一個(gè)Ig分子上兩條輕鏈的型別總是相同的。生物體內(nèi)可同時(shí)存在κ型和λ型的Ig分子,不同種屬生物體內(nèi)兩型輕鏈的比例不同。正常人血清Ig的κ: λ約為2:1,而在小鼠則為20:1。根據(jù)λ鏈恒定區(qū)個(gè)別氨基酸的差異,又可將λ鏈分為λl、λ2、λ3和λ4四個(gè)亞型(subtype)。

(二)可變區(qū)和恒定區(qū)
通過分析不同Ig重鏈和輕鏈的氨基酸序列發(fā)現(xiàn),重鏈和輕鏈靠近N端的約110個(gè)氨基酸序列變化很大,其他部分氨基酸序列相對(duì)恒定。因此,將Ig輕鏈和重鏈中靠近N端氨基酸序列變化較大的區(qū)域稱為可變區(qū)(variable region, V區(qū)),占重鏈1/4,占輕鏈1/2;將靠近C端的氨基酸序列相對(duì)穩(wěn)定的區(qū)域,稱為恒定區(qū)(constant region, C區(qū)),占重鏈3/4,占輕鏈1/2。
1.可變區(qū) 重鏈和輕鏈的V區(qū)分別稱為VH和VL。VH和VL中各含有3個(gè)氨基酸組成和排列順序高度可變的區(qū)域,稱為高變區(qū)(hypervariable region, HVR)或互補(bǔ)決定區(qū)(complementarity determining region, CDR), 包括HVR1(CDR1)、HVR2(CDR2) 和HVR3(CDR3),其中,HVR3(CDR3)變化程度更高。VH的3個(gè)高變區(qū)分別位于29~31、49~58和95~102位氨基酸,而VL的3個(gè)高變區(qū)分別位于28~35、49~56和91~98位氨基酸。VH和VL的3個(gè)CDR共同組成Ig的抗原結(jié)合部位(antigen binding site),決定抗體的特異性,是抗體識(shí)別及結(jié)合抗原的部位。
2.恒定區(qū) 重鏈和輕鏈的C區(qū)分別稱為CH和CL。不同型(κ或λ)Ig的CL長(zhǎng)度基本一致,但是不同類Ig的CH長(zhǎng)度不同,例如IgG、IgA和IgD包括CH1、CH2和CH3, 而IgM和IgE則包括CHl、CH2、CH3和CH4。


(三)鉸鏈區(qū)
鉸鏈區(qū)(hinge region)位于CH1與CH2之間,富含脯氨酸,易伸展彎曲,從而改變抗原結(jié)合部位之間的距離,有利于抗體結(jié)合位于不同位置的抗原表位。鉸鏈區(qū)易被木瓜蛋白酶、胃蛋白酶等水解,產(chǎn)生不同的水解片段。




二、抗體的制備流程

利用生物體對(duì)抗原物質(zhì)產(chǎn)生免疫應(yīng)答并產(chǎn)生抗體的機(jī)制,選用特定抗原物質(zhì)對(duì)機(jī)體持續(xù)刺激使其產(chǎn)生大量特異性抗體,之后收集純化得到針對(duì)特定抗原的特異性抗體,這一過程就是抗體制備??贵w制備主要步驟包括:獲得理想免疫原、免疫動(dòng)物、分離血清、純化抗體和抗體應(yīng)用檢測(cè),我們?cè)诖酥饕榻B獲得理想免疫原、抗體的克隆性和抗體純化的一些細(xì)節(jié)。



(一)獲得理想免疫原
制備抗體首先要獲得理想免疫原,通常免疫原可以是各種形式,不過理想的免疫原則需要進(jìn)一步的準(zhǔn)備。

1. 蛋白類抗原:對(duì)于天然易獲取的蛋白可以純化后直接作為免疫原;對(duì)于天然含量較少或難以提取的蛋白,可以通過基因工程重組表達(dá)的方式獲取。同時(shí)也可以選擇蛋白的特定的連續(xù)片段做多肽合成作為抗原,較短的多肽是半抗原,通常免疫原性較弱,需要進(jìn)一步偶聯(lián)載體蛋白(可選KLH、BSA、OVA)才能作為免疫原。
2. 小分子化合物:化合物抗原同樣是半抗原,也需要進(jìn)一步偶聯(lián)載體蛋白才能作為免疫原。為了便于偶聯(lián)載體蛋白,特定的化合物還需要進(jìn)行分子改造以便能成功偶聯(lián)。
3. 病原體:滅活的病毒或細(xì)菌可以直接作為免疫原。

免疫應(yīng)答過程
1. 抗原進(jìn)入機(jī)體
2. 抗原刺激 B淋巴細(xì)胞,使之分化增殖成為抗體分泌漿細(xì)胞和記憶細(xì)胞(初次免疫應(yīng)答)
3. 抗體主要由漿細(xì)胞分泌
4. 記憶細(xì)胞再次受到特異性抗原刺激后會(huì)被激活而成為分泌抗體的漿細(xì)胞(再次免疫應(yīng)答)
5. 記憶B細(xì)胞是長(zhǎng)命細(xì)胞,可以存活數(shù)月甚至機(jī)體終生

抗原
是一類在適合條件下能激發(fā)機(jī)體免疫系統(tǒng)發(fā)生免疫應(yīng)答,并能與免疫應(yīng)答產(chǎn)生的效應(yīng)物質(zhì)(抗體和效應(yīng)細(xì)胞)在體內(nèi)或體外發(fā)生特異性結(jié)合反應(yīng)的物質(zhì)。

抗原具有兩種性能:
? 免疫原性( immunogenicity) : 指抗原分子具有誘導(dǎo)機(jī)體產(chǎn)生免疫應(yīng)答的特性。
? 反應(yīng)原性( reactogenicity) : 指抗原分子與抗體或效應(yīng) T 細(xì)胞等免疫應(yīng)答產(chǎn)物發(fā)生特異性反應(yīng)的特性。

抗原決定簇(antigenic determinant)
指抗原上那部分可以引起機(jī)體產(chǎn)生抗體的具有特殊立體構(gòu)型和免疫活性的分子結(jié)構(gòu)和化學(xué)基團(tuán),叫做抗原決定簇。由于抗原決定簇通常位于抗原分子表面,因而又被稱為表位(epitope)。

抗原決定簇決定著抗原的特異性,即決定著抗原與抗體發(fā)生特異結(jié)合的能力??乖瓫Q定簇多位于蛋白質(zhì)的表面,一個(gè)蛋白質(zhì)大分子常有許多抗原決定簇??乖瓫Q定簇依賴于氨基酸序列和空間構(gòu)象兩種因素,又分為線性決定簇(Linear determinants)、構(gòu)象決定簇(conformational determinants)和新生抗原決定簇(Neoantigenic determinant)。
?線性決定簇(Linear determinants): 又稱為順序決定簇(sequential determinants) 或連續(xù)決定簇(continuous determinants),是抗原中直接由分子基團(tuán)的一級(jí)結(jié)構(gòu)序列構(gòu)成的決定簇。

?構(gòu)象決定簇(conformational determinants): 又稱為不連續(xù)決定簇(discontinuous determinants),是抗原中由分子基團(tuán)間特定的空間構(gòu)象構(gòu)成的決定簇,一般是由分子中不連續(xù)的若干肽鏈盤繞折疊而構(gòu)成。

? 新生抗原決定簇(Neoantigenic determinants): 通常是由于蛋白酶的切割活化以后才會(huì)出現(xiàn)的抗原決定簇,尤其是與一些蛋白和酶(如Caspase、insulin等)的加工和活化形式對(duì)應(yīng)。



(二)抗體的克隆性(Clonity)
一個(gè)抗原上可以有好幾個(gè)不同的抗原決定簇,因而使機(jī)體產(chǎn)生好幾種不同的抗體,最終產(chǎn)生出抗體是漿細(xì)胞。只針對(duì)一個(gè)抗原決定簇起作用的B細(xì)胞群或漿細(xì)胞群就是一個(gè)純系,純系的英文為Clone,音譯就是克隆。由一種B細(xì)胞群或漿細(xì)胞克隆產(chǎn)生的特異性抗體叫做單克隆抗體。單克隆抗體能目標(biāo)明確地與單一的特異抗原決定簇結(jié)合,就象導(dǎo)彈精確地命中目標(biāo)一樣。另一方面,即使是同一種抗原刺激機(jī)體,也存在多種抗原決定簇,相應(yīng)地就產(chǎn)生各種各樣的單克隆抗體,這些單克隆抗體混雜在一起就是多克隆抗體。

單克隆抗體和多克隆抗體產(chǎn)生區(qū)別示意圖

(三)抗體的純化
我們知道,一般免疫血清中含有特異性抗體和非特異性抗體,血清蛋白以及其他各種雜蛋白等,在制備特異性抗體過程中當(dāng)抗體的效價(jià)達(dá)到實(shí)驗(yàn)預(yù)期之后,需要對(duì)免疫血清進(jìn)行純化提取得到效價(jià)更高,特異性更強(qiáng),穩(wěn)定性更好的抗體。
目前,大多數(shù)商品化抗體使用Protein A或Protein G進(jìn)行純化。由于protein A或protein G 可以和抗體IgG分子的Fc段特異性結(jié)合。Protein A或protein G 作為配基可以被偶聯(lián)到瓊脂糖凝膠上,當(dāng)抗血清從中流過時(shí),特異性的IgG就與配基結(jié)合,其他雜蛋白則穿流而過。因兩種蛋白純化抗體時(shí)對(duì)不同宿主的抗體的結(jié)合能力不同,我們需要具體情況,分別選擇protein A 或protein G, 或者是protein A/protein G組合。一般兔抗(包括單克隆蛋白與多克隆抗體)、小鼠單抗IgG2a、IgG2b、IgG3, 選擇用protein A純化;而小鼠、大鼠和山羊的多克隆抗體、小鼠單抗IgG1、大鼠單抗,則選擇用protein G純化。


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